内部控制审计的主要内容通常包括以下几个方面：

一、内部环境

治理结构：包括董事会、监事会、管理层的职责划分和制衡机制。例如，检查董事会是否独立有效地行使决策和监督职能。

机构设置与权责分配：明确各部门和岗位的职责权限，避免职能重叠或缺失。比如，核实采购部门与财务部门在采购流程中的职责是否清晰明确。

内部审计机制：审查内部审计部门的独立性、审计范围和审计效果。

二、风险评估

目标设定：确定企业的战略目标、经营目标、报告目标和合规目标等是否合理清晰。

风险识别：评估企业是否能够全面识别内外部的各种风险，如市场风险、信用风险、操作风险等。例如，分析企业在面对市场波动时，是否能及时识别潜在的销售下滑风险。

风险分析：对已识别的风险进行分析，判断其发生的可能性和影响程度。

风险应对策略：检查企业针对不同风险制定的应对策略是否恰当有效。

三、控制活动

不相容职务分离控制：确保授权、审批、执行、记录等职责相互分离。比如，出纳与会计岗位不能由同一人兼任。

授权审批控制：审查各项业务的授权审批流程是否规范，权限是否明确。

会计系统控制：核实会计核算方法是否符合会计准则，财务信息是否准确完整。

财产保护控制：对资产的购置、使用、处置等环节进行监控，防止资产流失。

预算控制：评估预算的编制、执行和考核是否有效。

运营分析控制：分析企业的生产经营活动数据，以发现问题并及时调整。

绩效考评控制：检查绩效考核制度是否公平合理，能否激励员工积极履行职责。

四、信息与沟通

信息收集与传递：确保企业能够及时、准确地收集内外部信息，并在内部各层级之间有效传递。例如，销售部门能否及时将市场需求变化信息传递给生产部门。

信息系统：评价信息系统的安全性、可靠性和有效性，是否支持企业的运营和管理决策。

沟通机制：审查企业内部各部门之间、员工与管理层之间的沟通渠道是否畅通。

五、内部监督

日常监督：检查各部门是否对日常业务进行自我监督和检查。

专项监督：评估企业针对特定问题或业务进行的专项监督活动的效果。

缺陷报告与整改：审查企业发现内部控制缺陷后的报告机制和整改措施的落实情况。

内部控制审计涵盖了企业管理的多个方面，旨在评估企业内部控制的有效性，为企业的健康发展提供保障。