山东威海企业境外投资备案的申请流程如下：

确定投资项目性质：

中方投资额在 3 亿美元以下的境外投资，企业经威海市商务局转报山东省商务厅备案。

中方投资额在 3 亿美元以上的境外投资，企业经威海市商务局转报山东省商务厅，省商务厅审核后报商务部同意后备案。

若境外投资涉及敏感国家和地区、敏感行业，实行核准管理，企业需直报商务部合作司办理

网上注册与填报：企业通过商务部业务系统统一平台企业端进行注册（具体可查询企业端手册），选择对外投资信息管理业务应用，在线填写《境外投资备案表》并提交，并购项目还需在线填写《境外并购事项前期报告表》并提交。同时，企业需在系统内上传材料扫描版。

提交纸质材料（根据情况）：

境外企业备案上传资料：

境外机构备案上传材料：

《境外机构备案表》（系统里填写上传，打印加盖公章系统上传）。

营业执照复印件。

设立境外机构的内部决议。

设立境外机构真实性承诺书。

根据真实性审查工作需要，如有其它材料要求，将另行通知。

《境外投资备案表》（系统里填写，打印加盖公章系统上传）。

营业执照复印件。

对外投资设立企业或并购相关章程（或合同、协议）。

相关董事会决议或内部决议。

前期工作落实情况说明（包括可研报告、投资资金来源情况的说明、投资环境分析评价等）。

境外投资真实性承诺书。

属于并购类对外投资的，除上述材料外，还需提交尽职调查报告和《境外并购事项前期报告表》。

根据真实性审查工作需要，如有其它材料要求，将另行通知。

审核与备案：

威海市商务局审核：威海市商务局对企业提交的备案申请进行审核，审核内容包括投资项目的合法性、合规性和可行性等。如申请材料不完整或不符合要求，商务局可能会要求企业补充材料或进行修改。

转报与上级部门审核（如有需要）：根据投资金额，若需经山东省商务厅或商务部审核备案，威海市商务局将相应材料转报。上级部门按规定进行审核，审核通过后发放备案相关文件或证书。

领取备案结果：

备案通过：企业收到备案结果通知，若备案申请被批准，可继续进行境外投资。同时，应及时到境外当地使馆经商处报到，并按要求在商务部业务系统统一平台上传报到回执，还需根据实际出资情况及时在该平台填报月报和年报统计数据。

备案不通过：若备案申请被拒绝，商务局将说明拒绝理由，企业可根据告知的途径提出复议或申请行政诉讼。

整个备案流程中，企业需确保提交的材料真实、准确、完整，并按要求履行各项程序和义务。不同投资项目可能在具体要求和流程上存在差异，企业可提前与相关商务部门沟通咨询。