当审计意见存在局限性时，企业可以从以下几个方面进行自身的思考和判断：

深入了解审计过程和方法：企业应向审计人员询问审计所采用的抽样方法、测试范围以及所依据的准则和标准，评估这些方法和范围是否足够全面和恰当。

内部审查和分析：对相关业务和财务数据进行内部的详细审查和分析。比较不同期间的数据趋势，查看是否存在异常波动或不一致的情况。

行业比较和biaogan分析：将自身的财务状况、经营成果和内部控制与同行业其他企业进行比较，了解在行业中的位置和水平，判断审计意见的合理性。

咨询zhuanye顾问：请教外部的财务专家、律师或行业顾问，获取他们对审计意见的独立看法和建议。

考虑企业战略和长期目标：从企业的长期发展战略和目标出发，评估审计意见中指出的问题对未来发展的潜在影响。

风险评估：对审计意见中提及的问题进行风险评估，确定其可能引发的财务风险、经营风险和声誉风险等。

内部讨论和集思广益：组织企业内部的财务、业务、法务等相关部门进行讨论，从不同角度分析审计意见，综合各方观点。

审查内部控制制度：重新评估企业的内部控制制度是否健全有效，能否有效防范和发现类似问题。

历史经验借鉴：回顾企业以往类似问题的处理情况和结果，判断当前审计意见的可行性和适应性。

通过以上综合的思考和判断，企业能够更全面、客观地看待审计意见的局限性，并做出合理的决策和应对措施。

审计意见的局限性可能会给企业带来以下风险和影响：

决策失误风险：如果企业过于依赖存在局限性的审计意见来制定重大决策，如投资、融资、并购等，可能会导致决策失误，造成经济损失。

投资者信心受挫：不完整或不准确的审计意见可能使投资者对企业的财务状况和经营成果产生误解，进而降低对企业的信任，影响企业的股价和融资能力。

声誉损害：当审计意见的局限性被曝光或导致负面后果时，可能会损害企业的声誉，影响其在市场中的形象和竞争力。

监管处罚：若因审计意见的局限性导致企业未能如实披露重要信息或违反相关法规，可能会面临监管部门的处罚。

经营风险增加：企业可能无法及时发现潜在的财务问题和经营风险，导致问题积累和恶化，影响企业的持续经营能力。

内部控制失效：审计意见的局限性可能掩盖企业内部控制的缺陷，使企业无法及时改进内部控制，增加内部舞弊和管理失控的风险。

融资困难：金融机构在评估企业的信用状况和贷款申请时，可能对有局限性的审计意见持谨慎态度，增加企业的融资难度和成本。

合作关系受损：与供应商、客户等合作伙伴的合作可能受到影响，他们可能对企业的稳定性和可靠性产生怀疑，从而调整合作策略。