南京企业办理中长期外债备案登记的申请条件如下：

依法设立并合法存续、合规经营，具备健全且运行良好的组织机构；

有合理的外债资金需求，用途符合规定，资信情况良好，具有偿债能力和健全的外债风险防控机制；

企业及其控股股东、实际控制人近三年不存在贪污、贿赂、侵占财产、挪用财产或者破坏社会主义市场经济秩序的刑事犯罪，或者因涉嫌犯罪或重大违法违规行为被依法立案调查的情形。

需注意，企业外债资金使用应聚焦主业，有利于配合落实国家重大战略和支持实体经济发展，并且需符合以下条件：

不违反中国法律法规；

不威胁、不损害中国国家利益和经济、信息数据等安全；

不违背中国宏观经济调控目标；

不违反中国有关发展规划和产业政策，不新增地方政府隐性债务；

不得用于投机、炒作等行为；除银行类金融企业外，不得转借他人，在外债审核登记申请材料中已载明相关情况并获得批准的除外。

企业应当由境内控股企业总部（总公司、总行等）向国家发展改革委提交申请报告并附具有关文件。具体政策可能因地区和行业而有所不同，在实际操作中，企业应充分了解并遵守相关政策规定，确保外债融资活动的合规性和风险的可控性。同时，建议企业密切关注政策动态，并与相关部门保持良好的沟通，以顺利完成外债备案登记。

如果你想了解更详细的内容，可以参考国家发展改革委发布的《企业中长期外债审核登记管理办法》及相关配套文件，或咨询专ye的金融、法律机构。