北京海淀企业办理境外投资备案的流程如下：

一、前期准备

明确投资意向，进行项目可行性分析。

准备相关材料，包括但不限于：企业营业执照、税务登记证、组织机构代码证等基础资料；投资项目的商业计划书、可行性研究报告、投资合同等投资资料；企业近一年的财务报表（资产负债表、利润表、现金流量表）等财务资料；投资主体负责人身份证明、授权委托书等人员资料；根据投资项目的具体情况，可能需要提供的其他相关材料。

二、在线申报

登录商务部“境外投资管理系统”（或地方商务主管部门指定的系统）进行在线申报。

三、提交纸质材料

在线审核通过后，按照要求准备并提交纸质备案材料至北京市商务局。

需提交的资料主要有：商委的备案表格、章程、投资协议、董事会决议、真实性承诺书、前期工作情况落实说明（可研报告）、银行的资信证明等。

四、审核

商务主管部门对提交的材料进行审核，可能涉及现场核查。

五、获取备案证书

审核通过后，可领取或在线下载相关备案证书。具体包括北京市发展和改革委员会的备案通知书和北京商务局的企业境外投资证书，证书有效期为两年。

发改委备案通知包含公司名字、备案编号、项目内容、有效期、颁发时间等信息；商委备案证书包含公司名字、证书编号、印章、境内外的公司名字、投资金额、经营范围、主要项目内容等信息。

整个流程的办理周期通常为4-6周。

需注意，北京海淀企业办理境外投资备案涉及的具体要求和流程可能会根据相关政策法规的变化而调整，建议在办理前咨询的服务机构或相关，以确保备案顺利进行。

此外，如果公司不属于金融企业或者国企央企，并且投资金额小于三亿美金，只需要在市里做备案；如果公司注册地是在经济开发区的，那么需要在北京亦庄的商委做备案；其他情况则需在北京市商委做备案申报。

同时，备案完成后要按照相关规定进行境外投资活动的后续监管和报告，确保合规经营。例如，及时在商务部业务系统统一平台上传报到回执，根据实际出资情况填报月报和年报统计数据等。