南京市企业申请境外投资备案时，通常需要准备以下材料。请注意，具体要求可能会根据新的政策有所调整，因此在准备材料前，建议与当地商务部门确认新的要求。
基础材料《境外投资备案表》或《境外投资申请表》：在商务部业务系统统一平台填报后打印。
营业执照复印件：加盖公章的企业法人营业执照副本。
法定代表人身份证明：法定代表人的身份证复印件，并加盖公章。
项目相关材料对外投资设立企业或并购相关章程（或合同、协议）：
新设公司：提供境外公司设立章程（无中文原件的须提供中文翻译件，并加盖公章；未设立企业可由国内主体自行拟定相关章程，并加盖国内主体签章）。
并购项目：提供境外并购标的方的并购协议等材料（外文件须附上关键页翻译）。
相关董事会决议或出资决议：境内出资企业的出资决议，需要相关决定人签字并加盖公章。
前期工作落实情况说明：
包括尽职调查报告（第三方出具）、可行性研究报告、投资资金来源情况说明、投资环境分析评价等。
境外投资真实性承诺书：在线填报时下载填写，需签字并附上法定代表人身份证复印件。
属于并购类对外投资的，还需提交《境外并购事项前期报告表》。
其他可能需要的材料境外公司的注册证书及章程：如果境外公司已存在，需提供其注册证书和公司章程。
财务报表：包括但不限于审计报告，以证明企业的财务状况良好，净资产和净利润要大于投资额。
资金来源证明：如果是银行贷款，需提供银行项目授信；如果是自有资金购汇，需提供近期银行水单；如果是自有外汇，则需提供外汇账户资产证明。
其他辅助材料：根据具体情况，可能还需要提供其他辅助性材料，如行业许可证、环保评估报告等。
提交方式线上提交：通过商务部业务系统统一平台进行无纸化申请操作。
线下报送：对于不宜线上提交的材料，可以选择线下报送纸质材料办理申请。
注意事项所有提供的材料应当真实有效，如有虚假信息可能导致备案失败甚至法律责任。
根据投资项目规模的不同，审批流程也会有所不同，超过一定金额的项目可能需要经过省级或审核。
请确保所有非中文材料都附有准确的中文翻译，并且翻译件需加盖公章。
在线填报时，请注意经营范围、行业属性、项目简况等内容的填写要求。
以上是南京市企业申请境外投资备案所需的基本材料清单。由于政策可能存在变动，建议在准备材料之前，向当地商务局或相关部门咨询新的规定和要求。
