山东烟台企业办理境外投资备案的流程如下：

准备申请材料：

《境外投资备案表》（加盖印章）；

境外投资相关合同或协议（复印件）；

营业执照（复印件）；

对外投资设立企业或并购相关章程（或合同、协议）；

财务报表、真实性承诺书等其他材料（根据业务需要提供）。

提交备案申请：通过商务部业务系统统一平台提交申请材料，企业端进行注册，选择对外投资信息管理业务应用，在线填写《境外投资备案表》并提交，并购项目还需在线填写《境外并购事项前期报告表》并提交，同时上传材料扫描版45。

受理：烟台市商务局对外投资和经济合作科根据《境外投资管理办法》初步审核申请材料是否齐全、材料填写是否规范、完整等。

审核：烟台市商务局对申请材料进行审核，内容包括投资项目的合法性、合规性和可行性等。如申请材料不完整或不符合要求，可能会要求企业补充材料或进行修改2。

备案结果通知：审核完成后，商务局将向企业发出备案结果通知。若备案申请被批准，企业可继续进行境外投资；若被拒绝，商务局会说明理由，并告知企业可提出复议或申请行政诉讼的途径2。